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Mesquite 2.75

A modular system for evolutionary analysis.

 

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Mesquite 2.75 facilities

Vendor
Vendor`s Webhttp://mesquiteproject.org
Wayne P. Maddison and David R. Maddison webshot
OSWindows 2000, Windows XP, Windows Vista, Windows 7, Mac OS, Linux, Unix
Limitationsnot specified
Actualizedmore than year ago
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LocalizedEnglish
LicenseOpen source
SnapshotMesquite snapshot
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Mesquite manufacturer description

Mesquite 2.75 is software for evolutionary biology, designed to help biologists analyze comparative data about organisms. Its emphasis is on phylogenetic analysis, but some of its modules concern population genetics, while others do non-phylogenetic multivariate analysis. Because it is modular, the analyses available depend on the modules installed. Analyses include:

  • Reconstruction of ancestral states (parsimony, likelihood)

  • Tests of process of character evolution, including correlation

  • Analysis of speciation and extinction rates

  • Simulation of character evolution (categorical, DNA, continuous)

  • Parametric bootstrapping (integration with programs such as PAUP* and NONA)

  • Morphometrics (PCA, CVA, geometric morphometrics)

  • Coalescence (simulations, other calculations)

  • Tree comparisons and simulations (tree similarity, Markov speciation models)


There is a brief outline of features, which includes screenshots. Mesquite Medicine is not primarily designed to infer phylogenetic trees, but rather for diverse analyses using already inferred trees.
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Freeware is computer software that is available for use at no cost or for an optional fee.

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Mesquite categories

biology, Mesquite, analysis

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smarter
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Clean award
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MesquiteInstaller.exe » NSIS » SetAssumptionSoft.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » SetBranchLengths.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » SetBranchLengthsFromNames.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » SetBranchLengthsIfLessThan.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » SetSelBranchLengths.class - CLEAN
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MesquiteInstaller.exe » NSIS » SetToRooted.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » SetToUnrooted.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » SetTreeDefaults.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » ShadeNumbersDecorator.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » ShadeNumbersOnTree.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » 32showTree.gif - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » 64showTree.gif - CLEAN
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MesquiteInstaller.exe » NSIS » showTree.gif - CLEAN
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MesquiteInstaller.exe » NSIS » STCompatibilityTest.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » StoredTrees.class - CLEAN
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MesquiteInstaller.exe » NSIS » TreeLegendMaker.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » TreeLegendOperator.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » TreeNote.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » TreeNotesMaker.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » TreeNotesOperator.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » TreeOfContext.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » TreeValueUsingMatrix.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » Ultrametricize.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » UtilityCoordinator.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » ParamString.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » ValuesAtNodes.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » ValuesAtNodesOperator.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » aTreesIntro.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » DrawTreeUtil.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » FIleCheckThread.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » ManyTreesFromFileLib.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » SMessagePanel.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » SimpleTreeWindow.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » SimpleTreeWindowMaker.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » TaxonPolygon.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » TreeInfoExtraPanel.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » TreeOptimizer.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » AboutPanel.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » AboutScrollPane.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » AboutWindow.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » ClassPathHacker.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » ClockWatcherThread.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » ConfigFileRecord.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » DirectInit.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » EAWTHandler$EAWTH.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » EAWTHandler$QT.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » EAWTHandler.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » FileOpener.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » ModuleLoader.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » PhoneHomeThread.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » ProjectTreeWindow.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » SplashPanel.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » WelcomeDialog.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » ClassAdaptor.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » PropertyAdaptor.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » PropertyUtils.class - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » uninstall.exe - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » uninstall.exe » NSIS » Entries.bin - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » uninstall.exe » NSIS » Strings.txt - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » uninstall.exe » NSIS » Script.nsi - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » mesquitenexus.ini - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » shortcuts.ini - CLEAN
MesquiteInstaller.exe » NSIS » previousinstallinstructions.ini - CLEAN
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